Eigentlich sind Neo und Trinity gestorben, doch im vierten Teil der Reihe werden sie wieder putzmunter sein. Neo agiert erneut unter dem Namen Thomas Anderson und erkennt Trinity in einem Café nicht wieder. Der Therapeut (Neil Patrick Harris), bei dem Mr. Anderson in Behandlung ist, versucht zu ergründen, ob er weitere Episoden erlebe. Könnte eine neue Matrix erschaffen worden sein? Oder sind Neo und Trinity zurückversetzt worden und können sich nicht an die wirkliche Welt erinnern? Es war die Überraschung und zugleich die Rückbesinnung auf Altbewährtes: Keanu Reeves und Carrie-Anne Moss kehren in „Matrix 4“ in die digitale Welt zurück, Jada Pinkett-Smith wird ebenfalls erneut in der Matrix vorbeischauen. Der dritte Hauptdarsteller von einst, Laurence Fishburne als Morpheus, gab jedoch bekannt, dass er nicht in der nächsten Auskopplung zurückkehren wird. Auch Hugo Weaving alias Bösewicht Mr. Smith ist nicht in der Fortsetzung dabei.